Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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