Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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