Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms