Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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