Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOA1Q15788 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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NCOA1Q15788 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
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NCOA1Q15788 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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NCOA1Q15788 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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