Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRADDQ15628 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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