Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA2Q15560 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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