Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms