Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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