Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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