Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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