Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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