Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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