Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HNF4GQ14541 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms