Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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