Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTAN1Q13813 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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