Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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CDH18Q13634 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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