Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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