Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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