Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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