Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
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