Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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