Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTP4A2Q12974 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms