Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXC1Q12948 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXC1Q12948 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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