Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAB40BQ12829 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB40BQ12829 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB40BQ12829 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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