Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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EFEMP1Q12805 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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EFEMP1Q12805 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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