Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms