Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms