Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TLE4Q04727 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms