Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms