Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms