Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms