Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXC5Q00444 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms