Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKD1P98161 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKD1P98161 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKD1P98161 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKD1P98161 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKD1P98161 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKD1P98161 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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