Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAP84074 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAP84074 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAP84074 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAP84074 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAP84074 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms