Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRP54P61011 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP54P61011 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP54P61011 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms