Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA9P57773 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms