Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIM2P55344 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms