Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC12A2P55011 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms