Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms