Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms