Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA4P48058 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms