Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XCR1P46094 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms