Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms