Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRATP43155 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRATP43155 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms