Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms