Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTR1BP42025 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms