Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP214P35658 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP214P35658 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP214P35658 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP214P35658 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms