Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTX2P32243 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms