Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB2P29033 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB2P29033 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB2P29033 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms